你應該要知道的食事
食源性疾病爆發時須盡快找出致病原，以利於疫情的控制，透過基因定序的方式，可以迅速找出致病源並對症下藥，同時當出現新的病菌時，也可以透過基因定序解碼此病菌的毒性因子、入侵宿主的機制等，有益於了解病菌、找出解決方案。
撰文＝黃宜稜
位於亞熱帶地區的台灣，每年夏季除了防範登革熱、腸病毒等疾病之外，還需要注意食源性疾病，例如曾在2014年引起某校園食用營養午餐後集體腹瀉、嘔吐的仙人掌桿菌與金黃色葡萄球菌。
食源性疾病，又稱為食物中毒，為一項重大的公共衛生議題，指的是食用到受污染食物所導致身體不適的現象，最常見的臨床症狀為腹瀉、嘔吐。根據世界衛生組織在2015年底的報告指出，每年約有42萬人因食物中毒而死亡，5歲以下兒童更是屬於高風險族群，每年約有12.5萬人因此死亡，其中以東南亞與非洲區域最為嚴重，與當地的公共衛生發展有重要的關聯。
以往在食源性疾病爆發時，通常是透過血清型（serotype，運用不同細菌表面的抗原差異來分辨）、噬菌體分型（phage typing，運用噬菌體對細菌宿主的專一性，讓噬菌體去感染病源，以此分辨病源的類型）來判斷病源為何，不過隨著基因定序法的發展，有英國科學家便提出在食源性疾病爆發時，利用基因定序的方式來找出致病原，並在日前提出其進度報告。
第一個基因定序法為桑格定序法（Sanger Sequencing），是由諾貝爾獎得主「桑格」所提出的，亦為人類分子生物學的重大里程碑，爾後許多科學家陸續提出不同方式的定序法，統稱為次世代定序法（Next Generation Sequencing），可以同時定序幾百萬個DNA分子。目前基因定序法正被科學界廣泛運用，例如「人類基因組計畫」正是透過基因定序的方式來解碼人體的基因，並藉此去分析每段基因的功能性。
除了人類基因組計畫之外，「微生物基因體學」也成為21世紀的熱門科學之一，微生物幾乎存在於世界各個角落，但我們對微生物的了解卻顯得如此不足，透過基因定序來解碼微生物的DNA，除了可以幫助我們了解不同微生物的遺傳訊息之外，也可以去分析其各別的生存機制與毒性原理等。
現今科學家已完成許多微生物的基因解碼，並建立其越來越豐富的微生物基因資料庫，未來如果發生食源性疾病時，科學家可以利用基因定序的方式，快速的找出致病源。
例如當食物遭到沙門氏菌感染時，傳統上可能需要20天左右才能檢驗出其菌株類型（沙門氏菌目前約有超過2000種血清型），而現在只需要將沙門氏菌做基因定序後，再與基因資料庫相互對照，約1週左右就可根據其基因序列找出病株，如此便可儘早控制疫情、對症下藥。
此外，當出現新的病菌時，也可以透過基因定序來解碼此病菌的毒性因子、入侵宿主的機制等，更有益於了解新病菌並找出解決方案。將基因定序運用於食源性疾病的檢驗，雖然背後還有賴於健全的基因資料庫建立，但相信在科學家的努力之下，未來此項技術的運用與發展將會更加廣泛。
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參考資料：
▶Whole-genome sequencing of Foodborne Pathogens
▶世界衛生組織
▶衛生福利部
